Las actividades de Aedipe se rigen por la Asamblea General de todos los asociados. Como Órgano Ejecutivo de la asociación actúa un Consejo Nacional, constituido por un Presidente, Vicepresidente, un Secretario, un Tesorero y los Presidentes de las Agrupaciones y tantos vocales como Agrupaciones se constituyan.
También podrán ser nombrados por la Asamblea miembros del consejo Nacional los ex Presidentes de la Asociación o aquellos asociados a los que se responsabilice de una Comisión de Trabajo.
Las agrupaciones están regidas por su propia Asamblea, ala que pertenecen todos los asociados de dicha Agrupación, y por la Junta Directiva, integrada a este nivel por Presidente, Secretario, Tesorero y Vocales.
La Asociación se financia a través de:
