Las actividades de Aedipe se rigen por la Asamblea General de todos los asociados. Como Órgano Ejecutivo de la asociación actúa un Consejo Nacional, compuesto por los Presidentes de las distintas Territoriales y cada Territorial podrá designar un vocal más por cada 500 asociados.El conjunto elige al Presidente del Consejo, un Vicepresidente, un Secretario y un Tesorero.
También podrán ser nombrados por la Asamblea miembros del consejo Nacional los ex Presidentes de la Asociación o aquellos asociados a los que se responsabilice de una Comisión de Trabajo.
Las agrupaciones están regidas por su propia Asamblea, a la que pertenecen todos los asociados de dicha Agrupación, y por la Junta Directiva, integrada a este nivel por Presidente,Vicepresidente, Secretario, Tesorero y Vocales.
La Asociación se financia a través de:
